Mikel Merino (28) og Mikel Oyarzabal (27) spilte en viktig rolle i Spanias vei mot EM-troféet i Tyskland.
Merino scoret vinnermålet i kvartfinalen mot Tyskland, mens Oyarzabal avgjorde EM-finalen.
Mødrene til duoen, fra landsbyen Ellorio i Spania, har fått landsbyen tagget ned av radikale baskere med teksten "forræder" under spillernes navn.
Graffitien ble funnet utenfor en katolsk kirke, sammen med et banner som sa "Nei til assimilering av det spanske landslaget".
Marca har også omtalt saken, der landslaget ble kalt "horer" og et hakekors ble malt utenfor kirken.
Tidligere kommunestyremedlem i byen, Carlos García, har levert en klage for hatekriminalitet mot de skyldige.
Radikale baskere har kjempet for uavhengighet fra Spania og har blitt beskrevet som en terrorgruppe av flere lands politi.
Flere andre baskere var også med i landslaget under EM, inkludert Nico Williams, Unai Simón, Robin le Normand, Aymeric Laporte, Martín Zubimendi, Dani Vivian og Alex Remiro.